衛生部2月23日發布的2009年衛生工作要點提出，在深化醫藥衛生體制改革五項重點工作中，要注重發揮中醫藥作用，并給予政策傾斜。 要點中稱，扶持發展中醫藥事業，進一步完善并出臺扶持中醫藥事業發展的政策措施，開展中醫藥立法調研，完成法律草案起草。在深化醫藥衛生體制改革五項重點工作中，注重發揮中醫藥作用，給予政策傾斜。繼續實施培養名醫、創建名科、建設名院和中醫藥進農村、進社區、進家庭的“三名三進”工程，積極推進基層中醫藥服務網絡建設，加強基層中醫藥人才隊伍建設。繼續實施中醫“治未病”健康工程。深入開展“中醫中藥中國行”活動，推進中醫藥文化建設。加快中醫臨床研究基地建設，推進中醫藥繼承創新，使其在公共衛生、農村衛生、城市社區衛生服務以及重大、疑難疾病治療方面發揮更大作用。

    其他的7項衛生工作要點分別為： 今年要制訂出臺《關于深化醫藥衛生體制改革的意見》相關配套文件，制訂深化醫藥衛生體制改革的具體實施方案，進一步深化、細化和實化政策措施，主動加強與有關部門的溝通協調，做好各項制度、政策之間的配套和銜接，努力推進深化醫藥衛生體制改革工作。 加強基層醫療衛生服務體系建設，進一步完善新型農村合作醫療制度。加快縣鄉村三級醫療衛生服務機構和城市社區衛生服務機構建設，實現基層醫療衛生服務網絡的全面覆蓋；強化新農合的監督管理，提高新農合基金使用率和參合農民受益水平。 切實加強衛生應急工作，促進基本公共衛生服務均等化。制訂實施衛生應急體系建設和發展規劃，不斷健全中央、省、市（地）、縣四級衛生應急工作管理體系，實施突發急性傳染病防控戰略，不斷提高衛生應急工作總體水平；確定國家基本公共衛生服務項目，進一步做好艾滋病、結核病、血吸蟲病等重大傳染病防治、推進農村改廁和農村飲水衛生安全工程建設和婦幼衛生工作。 加強食品安全綜合協調和衛生監督工作。完善食品安全標準體系，制修訂乳品質量安全標準，會同相關部門組織開展食品安全標準清理工作。加強食品安全監測預警和風險評估工作，建立延伸到省、市（地）、縣的食品安全風險監測網絡。 加快建立國家基本藥物制度。組建國家基本藥物委員會，建立國家基本藥物目錄遴選、定期調整和部門協同工作機制，制訂并頒布國家基本藥物目錄（2009版）。制訂醫療機構對基本藥物優先選擇和合理使用的政策和措施，規范基本藥物生產、采購和配送合同管理。 推進公立醫院改革試點，加強醫療質量管理。選擇并指導試點城市制訂改革試點方案，加大政府投入，改革以藥補醫機制，改革內部人事和分配制度，維護公益性質，調動醫務人員積極性，探索建立規范的公立醫院管理體制和運行機制。 統籌協調各項工作的開展。加強衛生法制建設，加快衛生人才培養，完善衛生應急、衛生監督、醫療服務監管、新農合管理等方面信息系統建設，認真研究制訂中長期衛生發展規劃，啟動“十二五”衛生發展規劃和專項規劃的制訂工作，研究編制《中國衛生改革發展中長期規劃綱要（2010-2020）》（簡稱“健康中國2020”）。