2006年6月24日，科技部基礎研究司組織專家在杭州對能源清潔利用國家重點實驗室（浙江大學）進行驗收。以蔡睿賢院士為組長的專家組聽取了實驗室工作匯報，考察了實驗室，并與有關人員進行了座談。教育部科技司、浙江省科技廳、浙江大學的有關領導出席了會議。

    能源清潔利用國家重點實驗室是科技部2005年正式批準立項建設的23個國家重點實驗室之一。建設期間，實驗室根據科學發展前沿趨勢與國家戰略需求，積極調整學科布局，設置了化石燃料的高效清潔利用、新能源及先進能源系統、低品位能源的高效清潔利用、能源利用過程中的污染物生成、遷移、測量及控制和多相復雜反應系統中的理論模擬和數值試驗等5個研究方向。

    實驗室主管部門教育部和依托單位浙江大學對實驗室的建設給予了大力支持。建設期間共投入經費2250萬元，新建了1850m2科研用房并完成了儀器設備購置計劃。建立完善了痕量有機污染物生成、排放和控制實驗系統、多種污染物協同脫除實驗平臺、生物質能清潔利用實驗平臺、微生物反應器能源利用實驗平臺、廢棄物高溫熱處置實驗平臺、煤粉多參數在線測量試驗系統、余熱深度冷凍實驗臺和復雜反應多相流并行計算平臺等8個研究平臺。

    建設期間，實驗室承擔了一批國家重大科研任務并取得了突破性進展。獲國家自然科學二等獎1項，國家科技進步二等獎1項，1人獲得國家杰出青年科學基金資助，2位博士的學位論文分別入選2004、2006年度全國優秀博士學位論文，獲國家級優秀教學成果二等獎1項。

    驗收專家組對能源清潔利用國家重點實驗室在建設期所取得的成績給予了充分的肯定，認為該實驗室已在科學研究、隊伍建設、科研條件建設、運行管理和開放交流等方面實現了預期的建設目標，一致同意通過建設驗收。